En colaboración con la Secretaría de Educación Superior, Ciencia, Tecnología e Innovación (SENESCYT), el ISU-Cotacachi participa activamente en el "Programa Mis 100 Días Sirviendo al País", a través del cual lleva a cabo diversos proyectos y actividades para resolver problemas específicos que afectan a diferentes organizaciones en su entorno.
Entre las áreas de intervención priorizadas se encuentran: - Atención a comunidades y grupos vulnerables del sector y de la provincia. - El fortalecimiento de emprendimientos y actividades productivas. - Capacitación y educación a la comunidad. - Servicio comunitario.